Bem ao estilo de "Arquivo X", a histria do filme permanece um mistrio. Apenas o seguinte foi revelado: trata-se de uma histria independente, nos moldes de alguns dos episdios mais aclamados da srie, que conduz o complicado relacionamento entre Fox Mulder (Duchovny) e Dana Scully (Anderson) por caminhos inesperados. Mulder continua sua inabalvel busca pela verdade, e a intensa e extremamente inteligente mdica Scully mantm-se fortemente vinculada s investigaes de Mulder.
Fox
